Zdroje jsou v Black Skylands životně důležitou komoditou. Potřebujete je ke stavbě různých budov na Otcovské lodi, vaší hlavní operační základně.
Doplňování munice a zdraví je velmi snadné a lze jej provádět různými způsoby. První způsob, jak komunikovat s Arsenalem, a dostanete zdarma doplnění obou. Zbrojnice je něco, s čím můžete komunikovat na ostrovech nebo na své mateřské lodi, která má na jedné straně lékařský symbol a na druhé munici.
Uvnitř beden můžete také najít munici k rozbití. Zaútočte na ty bedny nebo cokoli, co se vám zdá rozbitné, a možná uvnitř něco najdete. Dalším způsobem, jak získat munici, je dokončit nepřítele útokem na blízko. Poté je zaručeno, že vypustíte munici!
Dostanete také lékárničku, která se dá použít jednou a pak musíte najít jinou, ať už sbíráním rostlin, nebo náhodně shozenou nepřítelem. Pokud nemáte ani jedno, můžete se rychle vrátit na svou loď a odpočinout si v posteli, a tím doplníte zdraví stejně jako Lumas.